Krister Lindén toimii FIN-CLARINin tutkimusjohtajana, jossa edistää humanistisen tutkimusinfrastruktuurin kehittymistä Suomessa. Tutkimusintressit liittyvät kielisovelluksiin ja monikielisiin kieliaineistoihin sekä näiden haravointiin, kielentunnistukseen, konvertointiin, jälkiprosessointiin, annotointiin ja tiedonlouhintaan.